Evènements passives dans Akkipuden

Attaque de Kyûbi à Konoha (racontée par Shinobu)
 
Après la fin de la Troisième Guerre Ninja, Minato fut choisi comme quatrième Hokage. Peu de temps après son élection, Shinobu et Madara retournent au village et, après que ce dernier, aidé par Shinobu, extrait Kyûbi de Kushina Uzumaki en l'utilisant pour attaquer Konoha. Minato fut capable de vaincre Madara, mais il fut hypnotisé par Shinobu. Minato, contraint de sacrifier sa vie et ne connaissant pas l'identité de l'assassin, fut forcé par Shinobu à renfermer Kyûbi dans le corps de son fils, Naruto Uzumaki. Malheureusement, Shinobu enlève Kushina grâce à sa technique de chaînes permettant de la capturer, enfermant ainsi dans son lieu secret pendant 18 ans. Beaucoup de ninjas moururent en défendant le village, et la plupart des survivants blâmèrent Naruto pour les actions du renard.
 
Massacre du clan Uchiwa (racontée par Shinobu avec coopération de Madara)
 
Quelques années avant le massacre, Shinobu empoissonne le Sharingan avec son Kureigan, forçant le clan Uchiwa à détruire le village. L'un de ses membres, Itachi Uchiwa, commença à dénoncer les actions des Uchiwa à la direction de Konoha. Itachi, hypnotisé par Shinobu, reçut ensuite l'ordre d'éliminer le clan pour empêcher un conflit sanglant et ensuite de vivre comme un criminel. Il fit ce qui lui avait été demandé par Shinobu, mais il ne put tuer son petit frère, Sasuke Uchiwa. Il convainquit le Troisième Hokage d'épargner Sasuke et de le protéger, mais il s'agit d'un échec. Il se joignit alors à l'Akatsuki. Il resta dans l'Akatsuki toute sa vie jusqu'à ce qu'il meure à l'issue de son affrontement contre Sasuke, mais il ne sera pas ressuscité avant la fin de la Quatrième Grande Guerre Shinobi.